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甲基化DNA标志物或预测胃癌

2017-3-12 10:58| 发布者: 新佐罗| 查看: 4829| 评论: 0

摘要: 美国胃肠病学院2015年科学会议于10月16-21日在火奴鲁鲁召开,根据本次会议上提交的一项研究新研究表明,在美国和韩国的队列中,多个甲基化DNA标志物可以准确地预测胃癌。 在这项研究中,我们通过全甲基化测序鉴定了 ...
美国胃肠病学院2015年科学会议于10月16-21日在火奴鲁鲁召开,根据本次会议上提交的一项研究新研究表明,在美国和韩国的队列中,多个甲基化DNA标志物可以准确地预测胃癌。

“在这项研究中,我们通过全甲基化测序鉴定了新的甲基化DNA标志物,随后在美国和南韩的患者队列中确认了最佳候选,”Bradley W.Anderson博士(梅奥诊所)在演讲中提到。

来自美国35名患者和韩国50名患者的17份甲基化DNA标志物候选具有完整的腺癌,Anderson和同事们对其进行了评估,并与对照组进行比较。美国组是与65名健康患者的正常胃黏膜上皮细胞对比。50名韩国患者在首尔大学医院接受治疗,作为自身对照组。据Anderson所说,在基线时取邻近的正常粘膜做样本。

对每一个标记物,应用逻辑回归分析计算曲线下面积(AUC)。来自显微组织的DNA是通过甲基化特异性聚合酶链式反应进行分析,通过β肌动蛋白对标志物水平标准化。

研究人员发现,前10位的DNA标记包括ARHGEF4,ELMO1,ABCB1,CLEC11A,ST8SIA1,SFMBT2,CD1D,CYP26C1,ZNF569和C13ORF18。

这10个标志物检测出美国组胃癌率为100%,南韩检测率为94%,其特异性为95%。

美国队列各标志物的AUCs分别为ARHGEF4:0.92;ELMO1:0.91;ABCB1:0.89;CLEC11A:0.88;ST8SIA1:0.85;SFMBT2:0.82;CD1D:0.82;CYP26C1:0.81;ZNF569:0.75;C13ORF18:0.66。

南韩队列各标记的AUCs分别为ARHGEF4:0.73;ELMO1:0.9;ABCB1:0.78;CLEC11A:0.75;ST8SIA1:0.8;SFMBT2:0.94;CD1D:0.87;CYP26C1:0.79;ZNF569:0.75;C13ORF18:0.79。

“这些标志物准确性高,而且一些标记在两组的判别中相似,”Anderson说。

特殊标志物,比如ELMO1在两个患者组都表现出高识别率。然而,其它标记,包括ARHGEF4,由于横跨正常组和患者组的背景,识别率更具多样。

“在美国组和南韩组中,研究人员鉴定出对胃癌具有高敏感性和特异性的有益甲基化DNA标志物,Anderson总结说。“将这些候选甲基化DNA标志物批准用于早期胃癌,还需要进一步研究。”


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