美科学家首次成功仿真完整生物体的生命周期

　　近期，美国斯坦福大学和克雷格·文特尔研究所的科研人员研发出了一款仿真软件，对一种生存在人类生殖道和呼吸道中的细菌——生殖支原体的完整生命周期进行了初步仿真，将其所有基因和已知的基因功能都囊括在内，而其他计算机建模顶多涉及少数功能或1/3 的基因。在用计算模拟代替真实实验的道路上，这一重要阶段性成果将有助于加深人类对癌症、阿尔茨海默氏症等疾病的理解。

　　早在10年前，科学家们就已经能够仿真新陈代谢活动，其模型至今仍被广泛用于研究细菌、酵母和光合生物。蛋白质合成等也另有惯用的模型。这些模型提供了大量细菌方面的科学论文，其中900多篇为证明新模型的精确性提供了数据支撑。

　　仿真是在一个由128台计算机组成的集群上完成的，从分子水平上建模，模型由多个子模型组成，各子模型对应不同的细胞功能，使用不同的数学运算方法。该模型记述了包括DNA、RNA、蛋白质和代谢物在内的28种分子间的互动。首次真正意义上模拟出了细菌的自由生长情况，被认为是计算生物学这一新兴领域中的一个重要进展，可以和人造细菌的诞生相媲美。之所以选择生殖支原体为仿真对象，是因为这种会导致性传播疾病的寄生菌拥有所有独立生命体中最小的基因组，仅有525个基因。